Képzelj el egy nyalókát, amely száz ember erejét adja neked, vagy egy rakétahajtású hátizsákot, amely elrepít a Holdra, vagy, hogy genetikailag átalakítod a kutyádat, hogy beszélni tudjon. Johnny Test képes mindezt megtenni, sőt még többet is. Ez a történet a 11 éves Johnnyról és az ő genetikailag megtervezett szuper kutyájáról, Poochie-ról szól, akik különös tudományos felfedezésekbe vetik magukat Johnny zseniális ikerhúgaival, a 13 éves Susannal és Maryvel: kísérletekbe, melyek általában pusztítással járnak és amelyek mély vízbe dobják Johnnyt, akit meg kell menteni mielőtt még túl késő lenne.