1995-ben Kiryu és barátai ki akarnak törni szabályokkal teli életükből, és kirabolnak egy játéktermet. A játékterem azonban a Kamurocsót uraló befolyásos jakuzaklán, a Doujima család irányítása alatt áll. A 2005-ös idősíkon Kiryu kiszabadul a börtönből, majd Date nyomozótól megtudja, hogy barátai veszélyben vannak. Úgy dönt, hogy visszatér Kamurocsóba, és megvédi őket.
1995-ben járunk. Kazama, a Napraforgó Árvaház vezetője abban reménykedik, hogy Kiryu, Nishiki, Yumi és Miho tisztességes életet fognak élni, azonban végül mind a négyen a jakuza alvilágába csöppennek. 2005-ben az Omi szövetség és a Tojo klán közötti feszültség a tetőfokára hág egy tízmilliárd jenes rablás miatt.
1995. A Doujima család megtalálja Edgar húgát, akire az rábízta a földje eladásához szükséges hivatalos pecsétet. Yumi Oszakába utazik, hogy megkeresse elhidegült nővérét. Mindeközben az Edgar pecsétjéért folyó harc elfajul. 2005-ben Aiko eltűnik, hátrahagyva lányát, Harukát. Kiryu és Yumi elhatározzák, hogy megvédik Harukát, ám hamarosan érdekes felfedezést tesznek.
1995. A Kiryut, Nishikit, Yumit és Mihót összekötő szinte családi kötelék tragikusan szétbomlik. 2005. Vajon Kiryu képes megakadályozni a Tojo klán és az Omi szövetség közötti háborút? Hogyan fogja Kiryu és Nishiki megoldani a tíz évre visszanyúló konfliktust? És ki rejlik Sindzsuku Gonoszának álarca mögött? A növekvő feszültségek végső leszámolással fenyegetnek Kamurocsóban.